Totto-chan adalah seorang gadis berusia tujuh tahun yang selalu bersemangat dengan dunia di sekelilingnya. Namun, ketika "kegembiraan" ini membuatnya dikeluarkan dari sekolah publik setempat, di pindah ke sekolah baru di mana anak-anak bebas untuk mengeksplorasi apa pun yang menarik minat mereka. Di sini, Totto-chan mulai berkembang - bahkan ketika Jepang tenggelam sedang berada dalam Perang Dunia Kedua.